Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C18orf8Q96DM3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms