Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CCDC124Q96CT7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms