Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TMIGD2Q96BF3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TMIGD2Q96BF3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms