Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRG4Q92954 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRG4Q92954 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms