Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TAF4BQ92750 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms