Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBXN4Q92575 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBXN4Q92575 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms