Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NR4A3Q92570 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms