Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TM9SF4Q92544 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms