Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
DUSP18Q8NEJ0 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DUSP18Q8NEJ0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms