Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ZNF248Q8NDW4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms