Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms