Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RPAP2Q8IXW5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms