Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
C9orf40Q8IXQ3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C9orf40Q8IXQ3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms