Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
BHLHA9Q7RTU4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms