Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q6P435 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q6P435 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q6P435 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q6P435 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q6P435 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q6P435 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q6P435 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q6P435 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q6P435 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q6P435 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Q6P435 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Q6P435 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Q6P435 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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