Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RTL6Q6ICC9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms