Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
BRMS1LQ5PSV4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms