Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GREB1Q4ZG55 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms