Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SYTL3Q4VX76 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms