Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms