Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GEN1Q17RS7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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