Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CDKN3Q16667 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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