Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HIF1AQ16665 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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