Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SYPL1Q16563 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SYPL1Q16563 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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