Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PCSK7Q16549 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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