Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SNAPC1Q16533 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SNAPC1Q16533 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNAPC1Q16533 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNAPC1Q16533 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNAPC1Q16533 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SNAPC1Q16533 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNAPC1Q16533 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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