Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NTRK3Q16288 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
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