Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ZNF56Q15929 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms