Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC1A5Q15758 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms