Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIP4Q15650 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIP4Q15650 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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