Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SEC23BQ15437 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms