Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NCAPHQ15003 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NCAPHQ15003 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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