Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CAPSQ13938 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms