Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SHROOM2Q13796 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SHROOM2Q13796 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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