Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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