Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CUL3Q13618 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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