Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
MTMR3Q13615 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms