Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKD2Q13563 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKD2Q13563 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
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