Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE3BQ13370 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDE3BQ13370 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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