Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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SKP2Q13309 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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SKP2Q13309 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SKP2Q13309 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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