Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SCGB2A2Q13296 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms