Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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NR1H3Q13133 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NR1H3Q13133 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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