Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPS1Q13098 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPS1Q13098 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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