Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MRPL28Q13084 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms