Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPRJQ12913 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.1 ms