Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NFIAQ12857 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
NFIAQ12857 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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