Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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FOXO1Q12778 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXO1Q12778 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXO1Q12778 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXO1Q12778 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXO1Q12778 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXO1Q12778 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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FOXO1Q12778 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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