Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
FAM27E3Q08E93 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms