Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms