Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CACNG1Q06432 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms